А если попробовать загрузиться в режиме "recovery mode"?
не помогает.
Загрузился с лайва, примонтировал корень, все на месте.
Решено: из под лайва сделал проверку ФС - ресет, и все вернулось на свои места. Подозреваю проблема в наличии битых секторов на диске. О чем сообщает "Дисковая утилита".
Оффтоп: как в название темы добавить "РЕШЕНО"?