Переходим сюда /usr/share/themes/Ambiance/gtk-2.0/apps и на ходим там файл с названием gnome-panel.rc и редактируем его командой sudo gedit '/usr/share/themes/Ambiance/gtk-2.0/apps/gnome-panel.rc'
В открывшемся файле находим строчку bg_pixmap[NORMAL] = "img/panel.png" и изменем её на
bg_pixmap[NORMAL] = "img/panel.pn" и сохраним изменения.Теперь всё закрываем,правой кнопкой по верхней панели/свойства/фон/ выбираем заливку цветом/сохраняем
Потом,/изменить фон раб стола/темы/ с ambiance выбираем любую другую тему и затем снова ambiance.Цвет панели поменяется или станет прозрачным