А что именно, если не секрет, вы хотели бы настроить в squid'е? Антивирус я бы ставить не стал, т.к. лишний гемор при учете, что на конечных компах он все равно есть. Если хотите настроить ограничения, то готовтесь либо настраивать что-то типа squidGuard либо много писать:).
Я не давно настраивал подобную систему, только я не ставил прозрачный прокси из-за того что статистика пропадает. Настройка браузеров делается автоматически через wpad.