У virtualbox есть собственный репозиторий, видимо, есть смысл при несвойственных системе ядрах (raring для precise вроде не вполне свойственно, не?) попробовать ставить оттуда, а не старую репозиторскую версию.
Типа там
deb http://download.virtualbox.org/virtualbox/debian squeeze non-free #VirtualBox
Про 3.8 в precise. Вчера поставил xubuntu 12.04 и последовательно обновил до текущий. Понял, что сосуществование ядер с -lts-raring приводит к многочисленным конфликтам (mesa, видеодрайвера, какие-то иксовые библиотеки), нагнетать не стал и тупо обновился до 13.04 с тем же ядром 3.8.