Японский бох! :facepalm: три раза! Ну, блин, кто так делает?
yurik@yurik-pc:~$ mysql_config --cflags
-I/usr/include/mysql -DBIG_JOINS=1 -fno-strict-aliasing -g
yurik@yurik-pc:~$ mysql_config --libs
-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -lmysqlclient -lpthread -lz -lm -lrt -ldl
yurik@yurik-pc:~$
Теперь, дети, внимание на доску. Учимся читать по слогам!
В соответствии с выводом команд приведенным выше:
1) я в упор не вижу стадию компиляции и какие у тебя там флаги. обязаны быть "-I/usr/include/mysql -DBIG_JOINS=1 -fno-strict-aliasing -g" можно без -g. Без остального ты будешь огребать проблемы.
2) Я хз где ты надыбал вот это "-L/usr/lib/mysql -lmysqlclient" обязано быть "-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -lmysqlclient -lpthread -lz -lm -lrt -ldl"
3) Я хз куда ты там криво вписывал все эти флаги но, когда всё правильно указано, библиотеки NetBeans ставит после списка объектных файлов
g++ -Wextra -o dist/Debug/GNU-Linux-x86/cdr_uploader_1 build/Debug/GNU-Linux-x86/inotify_watch.o build/Debug/GNU-Linux-x86/main.o build/Debug/GNU-Linux-x86/dir_list.o build/Debug/GNU-Linux-x86/cdr_reader.o build/Debug/GNU-Linux-x86/txt_cdr_reader.o build/Debug/GNU-Linux-x86/process_files.o -L/usr/lib/oracle/11.2/client64/lib -lboost_thread -locci -lclntsh -lnnz11 -lrt
для примера
Это очень важно! Ибо gcc собирает всё по порядку, у тебя он берет библиотеку (если конечно вообще её находит) смотрит что она ему нафиг не упала и выкидывает её. Берет все объектники, собирает их и говорит что им не хватает символов (они были в библиотеке, но он её уже выкинул)
То что у тебя что-то собирается на одной платформе и не собирается на другой это значит что напрямую нельзя пихать флаги от одной сборки mysql для другой и надеяться на авось. Придерживайся правил сборки установленных разработчиками mysql и всё будет в порядке.

Примерно так
"/usr/bin/make" -f nbproject/Makefile-Debug.mk QMAKE= SUBPROJECTS= .clean-conf
make[1]: Вход в каталог `/home/yurik/work/mysql_test_1'
rm -f -r build/Debug
rm -f dist/Debug/GNU-Linux-x86/mysql_test_1
make[1]: Выход из каталога `/home/yurik/work/mysql_test_1'
ОЧИСТИТЬ SUCCESSFUL (общее время: 62ms)
"/usr/bin/make" -f nbproject/Makefile-Debug.mk QMAKE= SUBPROJECTS= .build-conf
make[1]: Вход в каталог `/home/yurik/work/mysql_test_1'
"/usr/bin/make" -f nbproject/Makefile-Debug.mk dist/Debug/GNU-Linux-x86/mysql_test_1
make[2]: Вход в каталог `/home/yurik/work/mysql_test_1'
mkdir -p build/Debug/GNU-Linux-x86
rm -f build/Debug/GNU-Linux-x86/main.o.d
g++ -std=c++0x -fno-strict-aliasing -c -g -DBIG_JOINS=1 -I/usr/include/mysql -std=c++0x -fno-strict-aliasing -MMD -MP -MF build/Debug/GNU-Linux-x86/main.o.d -o build/Debug/GNU-Linux-x86/main.o main.cpp
mkdir -p dist/Debug/GNU-Linux-x86
g++ -std=c++0x -fno-strict-aliasing -o dist/Debug/GNU-Linux-x86/mysql_test_1 build/Debug/GNU-Linux-x86/main.o -L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -lmysqlclient -lz -lm -lpthread -lrt -ldl
make[2]: Выход из каталога `/home/yurik/work/mysql_test_1'
make[1]: Выход из каталога `/home/yurik/work/mysql_test_1'
СОБРАТЬ SUCCESSFUL (общее время: 776ms)