Попробовал, из "Центра приложений", "Remotedesktop client" (графическая запускалка к rdesktop) и "Remote Desktop Viewer". С мышой всё то-же - "леворукая на леворукую" дают в итоге "праворукую".
Какие-нибудь мысли есть на эту тему или только тупо менять каждый раз кнопки в удалённой машине?