Марк знает лучше, что тебе нужно.
Меня вот тоже жутко бесит оранжево-фиолетовая
цветовая гамма. Хотя поначалу (в версии 10.04)
это показалось новым и интересным.
А если серьёзно, то в двух словах объяснить
не получится.
Это зависит от версии. В 11.10 я поменял цвета,
и в 12.04 всё тоже работает как надо, а в 12.10
уже не пашет.
В /usr/share/themes лежат каталоги, и в них —
файлы, отвечающие за цвета рамок окон (metacity),
за цвета приложений на gtk-2 и gtk-3, а также
отдельных приложений — терминала, gedit'а и т. п.
Темы значков лежат отдельно.
Напишите сначала, какая у вас Ubuntu и какая оболочка.