Решил похожую проблему: на флехе Transcend 8Gb с антивирусом на отдельном разделе, который через 3 месяца перестал работать и был рид онли. Помогла утилита AlcorMP (! там много версий) для прошивки контроллера + очень много настроек. НО, возможно я не нашел 100% подходящую версию или параметры не совсем правильно подобрал, прошитая флеха периодически через несколько месяцев дает сбои. Итог: ненужный раздел был удален.