Во 1 какой смысл создавать три зеркала на двух устройствах + еще расширенный том? вы понимаете что в случае отказа одного диска у вас откажут все три зеркала?
Во 2 правильно подсказывают: дождитесь окончания синхронизации, до того момента вы ничего не сделаете.
В 3 у вас физический размер сектора диска 4 кб и фдиск вам верно говорит что раздел не выровнен по физическому сектору. Настоятельно советую выровнять при помощи gparted или ручками, иначе производительность будет страдать ощутимо. По дее это надо было делать до создания рейда. Теперь что будет если ровнять на живую не знаю, имхо проще прибить и перестроить.