Shred, т.к. при очистке корзины файлы удаляются навсегда.
А я вот недавно прочитал, что в журналируемых файловых системах (ext3, ext4 и др), которые используются в Linux, shred не эффективна, т. к. эта утилита предполагает, что файлы перезаписываются "на месте". А в Ubuntu с такими файловыми системами, как я понял, режим журналирования включён по умолчанию.