в стандартных репозиториях находится стабильная версия, в бэкпортс - разрабатываемая (для тестирования).
сейчас допиливают версию 4.11, не добавляют функционал, а исправляют ошибки, так что нарваться на проблемы в бэкпортс, на мой взгляд, будет сложно (но вполне возможно). однако для новичка все же лучше использовать стабильную версию из стандартного репозитория.