Нет, пхп и sql непричем. Вайн говорит вам о том, что у вас разные версии вайнсервера (служба, выполняющая роль "ядра венды" в вайне) и клиента. Иначе говоря у вас сейчас мешанина из двух разных версий, каким способом ставили?
Скорее всего, проблема пришла из какого-нибудь репозитория.
Решение:
1)Копируем все, что нужно из .wine
2)Удаляем все пакеты вайна через синаптик вместе с настройками (пометить на полное удаление)
3)Отключаем все репозитории, в которых есть вайн-пакеты
4)Удаляем .wine
5)Устанавливаем вайн заново - либо стандартным способом (sudo apt-get install wine) либо, если нужна версия не из репозитория, лучше собрать из исходников.
Главное - не пользуйтесь левыми репозиториями, коих куча 
Выполнил следующи действия:
1) Зашёл в синаптик, в поиске вбил wine и удалил все установленные пакеты полным удалением
2) В синаптике зашёл в репозитории > другое по и там в самом низу было 2 репозитория с вайнов, удалил их
3) Затем прописал все эти команды:
sudo apt-get purge wine
sudo apt-get autoremove
sudo apt-get clean
sudo apt-get install -f
rm -r ~/.wine
rm -r ~/.local/share/applications/wine/Программы
rm -rf ~/.local/share/applications/wine*
4) Перезапустил систму
5) Установил заного вайн командой: sudo apt-get install wine
6) Написал в терминале: wine regedit и получил в итоге ту же ошибку, только с другими цифрами:
wine client error:0: version mismatch 431/441.
Your wineserver binary was not upgraded correctly,
or you have an older one somewhere in your PATH.
Or maybe the wrong wineserver is still running?
Даже не знаю что уже делать)
Тема: Photoshop\wine\ cmd.exe /c echo '%ProgramFiles%' returned empty string (Прочитано 8651 раз)
