Сам столкнулся с такой проблемой, с запуском приложений на Ubuntu 14.04 LTS, при удаленном подключении к Win2008 R2. При этом, при подключении к Windows Server 2012, приложение запускалось. Решение было такое: Вместо диска 'С', писать %SYSTEMDRIVE% .Например: %SYSTEMDRIVE%\Program Files (x86)\1cv8\common\1cestart.exe. Надеюсь, это кому то поможет и сбережет нервы)))