пакеты типа flashplayer с сайта Adobe или пакет msttcorefonts, который пытпется стянуть с других сайтов экзэшники со шрифтами это так называемые "онлайн-установщики". Сама apt просто физически не может качать ниоткуда кроме как из списка sources.list - просто не знает она ничего другого.
А у упомянутых пакетов в скрипте установки прописано скачивание нужных файлов из своих источников - бинарников физически нет в репозиториях.
Да, по другому их не установить. Да, с этим ничего нельзя поделать. Да, авторы пакетов - кака.ки. Ещё вопросы?