Указать ворду другое место сохранения копий файлов - это не вариант. Общей папкой пользуются десятки человек в организации и каждый может открыть файл на общем ресурсе. да и компьютеров столько же. А вот на Linux стали переходить и появились проблемы, но компов в линксом около 5, а с виндой десятки
Здесь надо ИМХО какой-нибудь скрипт, который делает невидимыми файлы, начинающиеся с ~$