for f in ./*.tar.gz ; do du -b $f ; done | sort -uk1,1 | cut -f2 | xargs -I{} cp -v {} Output_directory/
Скопирует только по одному файлу по размеру. Но вам следует понимать, что одинаковый размер - абсолютно не значит, что файлы одинаковы. Судя по хэш-сумме, у вас все файлы уникальны.