Скорее всего темы не для Вашего менеджера окон. Если стоит базовая Ubuntu, то темы надо брать GTK и Metacity. Посмотрите темы на сайте
http://gnome-look.org. Разделы GTK 2.x и Metacity. Должно работать.
На самом деле, бывают битые темы. Потому и не определяются. И еще, архив может содержать не только темы, но и иконки, обои и т.д., в этом случае надо распаковать архив, одним из внутренних архивов, будет тема.