Никаких web-серверов ставить не нужно.
Классическое решение Вашей задачи заключается в установке на Windows-сервер любого кэширующего прокси (а скорее всего у вас уже стоит что-то вроде ISA).
В настройках apt-get выставляете использование прокси при подключениям к репозитариям (http_proxy).
В результате, если хоть кто-то уже выкачивал пакет, повторно он будет браться из кэша прокси.
Организация полноценного репозитария, судя по постановке задачи, не требуется.