Скажу честно: я в убунте не слишком крут. Возможно, поэтому не вполне понимаю что Вы пытаетесь делать.
Я бы сделал так: грузанулся бы с LiveCD, запускаем графический терминал, натравливаем sudo fsck на корневой раздел на винте (типа /dev/sda1), ну и следим за выводом. Потом подмонтируем, командой mount проверяем отсутствие флага ReadOnly и делаем с fstab что душе угодно