Через меню доступно управление закладками, там будет возможность экспорта. Если меню недоступно, то в дебрях домашней папки есть файлы *.json
Это файлы с закладками и их запасными копиями. Их нужно отдельно сохранить и их можно импортировать в свеже установленный FF.
Настройки и закладки FF храняться в каталоге "~/.mozilla"
Символ "." означает спрятанный файл, такой файл или каталог может быть не видно в файл-менеджере, пока файл менеджер не настроен на показ таких файлов.
Я бы удалил "~/.mozilla" перед новой установкой FF. Причём можно не переустанавливать, а просто сохранить отдельно содержимое "~/.mozilla", удалить "~/.mozilla", запустить FF и ... настраивать заново, доставая необходимое из старой копии "~/.mozilla".
Посмотрите, чтобы в "~/.mozilla" не было чего-то относящегося к ThunderBird и др. их приложениям.