Можно-то можно. Можно получить список всех усьановленных пакетов (dpkg-query в помощь), потом сохранить все нужные папки с настройками из home. переустановить систему с форматированием системного раздела и скормить сохранённый список пакетов aptitude install, главное не забыть все репозитории подключить нужные. Я так делал - достаточно быстро получается и многое восстанавливается. Правда что-то приходится настраивать руками. Некоторые вообще целиком home сохраняют, тогда сохраняются вообще все настройки, но при даунгрейде могут возникнуть нестыковочки, хотя попробовать возможно и стоит.