во-во. есть там мбр и есть там загрузчик. если ставил по-нормальному, просто как на храд, то будет тебе гроб2, работающий просто в скрытом режиме, т.е. менюшка не показывается. поймать ее можно, удерживая шифт при загрузке. чтоб надолго - в /etc/default/grub закомментируй строки со словом hidden.
если ставил через пень-колоду. какой-нибудь да загрузчик быть обязан, и конфиг у его тоже должен быть.
ЗЫ. сама идея кажется нецелесообразной. если уж хочется быстрое ядро - собирай под свое железо, а от флэшки ты в любом случае реактивной производительности не добьешься, ибо все равно все упирается в скорость чтения/записи устройства. если данные читаются-пишутся медленнее, чем их возможно обработать - что толку наращивать потенциальную скорость обработки оных? максимум, что можно выжать - Reiser4 в качестве фс (если хочется экстрима, хотя много все равно не даст) и параметры монтирования noatime и nodiratime - вот это должно облегчить жизнь устройству