Ну начиная от истории браузеров - практически в любом браузере есть настройка "Удалить историю".
папочку /var/log/ почистить можно.
файлик в домашнем каталоге .bash_history очистить.
Ещё: Открываешь "Центр приложений" и там в поиске вводишь "clean" - выдаст кучку утилит по очистке. Какая лучше не знаю ибо не юзал.
Попробуй поставь несколько, может что поможет.
А лучше всего - достаешь жесткий диск и кладешь его под наковальню.
Хотя если верить фильмам о спецслужбах то они даже если расщипить на атомы этот диск, всё равно вытащат от туда информацию.
