А что, все в одном файле?
Тогда только руками.
SVN надо было ставить сначала, до раздачи кода на доработку. Да и вообще, заранее договариваться о процедуре внесения изменений.
Теперь можно так выйти из положения.
Завести репозиторий SVN.
В trunk - исходный код, который был до доработки.
Доработки от разных авторов - в разные ветки (branch).
А потом постепенно сливать ветки в trunk.