Команды:
/etc/init.d/apache2(invoke-rc.d apache2) reload
и
/etc/init.d/apache2(invoke-rc.d apache2) restart
Есть предположение что RESTART полностью перезапускает, а RELOAD только файл конфигурации и список сайтов. Но хотелось бы иметь что то большее чем догадки.