99% что ПО (ubuntu, драйверы) не виновато, но всё-же:
Какие дросселя шелестят, те что возле процессора?
Если да - скорей всего что-то с питанием процессора.
Большие конденсаторы возле процессора и слотов модулей памяти не вздулись (хоть и немного)?
Если да, то заменить их, или мат. плату на ремонт.
P.S
Если я прав, компьютер в таком сост. лучше не включать - может умереть процессор.