RazrFalcon, скопипастил ваш пример -- всё работает:
$ cat 1.txt
Печаль
Непреодолимая печаль..
Снова.. и снова - этот сон...
Я.. плачу?
Это он!
Я печален
и в тоже время я смеюсь.
Я ранен?
Сегодня я все же увижу его...
еще чуть-чуть..
еще совсем чуть-чуть..
Сон?
Опять этот сон.
$ cat 1.txt | egrep '([^\.]|^)\.{2}([^\.]|$)'
Непреодолимая печаль..
Снова.. и снова - этот сон...
Я.. плачу?
еще чуть-чуть..
еще совсем чуть-чуть..
Возможно, у вас там непечатные символы, которые искажают конечный результат.
Надо смотреть оригинал файла.