Сам столкнулся с похожей проблемой сегодня. Не знаю, как вы тут её решили, но у меня процесс /usr/bin/python загружал на 100% попеременно одно из 4-х ядер. Причем процесс не отображался Диспетчером задач, поэтому пришлось убить его через htop от рута. Сразу после убийства процессор расслабился, вентиляторы сбавили обороты.
Xubuntu 12.10, xfce 4.10
Загрузка проца началась после того, как в стиме для линуха включил режим big picture, сам стим при этом закрылся, а проц нагрузился.