У меня было подобное когда пробовал разные комбинации переключений. Хотя оставлял выбранную ( чаще CapsLock ), после резета система все равно добавляла что-то от себя, также чаще по дефалту Alt+Ctrl, поэтому не работало ни то ни сё.
В случае PikselNsk, при "Иногда перестаёт переключаться раскладка" стоит зайти в "Раскладка клавиатуры\Параметры\Клавиша(и) для смены раскладки".
Пару раз переправил, очевидно система успела понять - не забалуешь, раскладка осталась по моему предпочтению CapsLock.
В Раскладка клавиатуры\Параметры также надо убедиться, лишнего ничего, как пример чего-то от экзотики в клаве.
Это если все на поверхности, не надо лесть в конфиги