Дополню мысли.. Все же не есть гуд так, как есть у меня. Но уже разобрался на треть.. это радует.
Так вот.
Что бы было хорошо, нужно прописать в DocumentRoot ~ и тогда все будут попадать в свою домашнюю папку, которой был ограничен при добавлении пользователь.
С правами большая путаница, и при рестарте системы нужно постоянно менять эти права.. то же очень не есть гуд..
Разбираюсь с этим моментом.. допишу, если что узнаю..