Если бы хотя бы десяток процентов, можно было бы говорить о разнице. А меньше пол-процента это не разница, это погрешность измерения.
Вот когда я генерацию меню на сайте конторы оптимизировал, там была разница в 30 раз. Не думаю, что сменой бэкэнда с apache2handler на fpm я мог бы добиться чего-то подобного.