У заархивированного файла fb2 есть пункт "Открыть с помощью ...", но настройки не сохраняются.
Внезапно обнаружил, что и незаархивированный файл fb2 пытается открыться в Libreoffice.
Дальше было проще. В контекстном меню выбрать "Открыть с помощью ...", но далее не "Чтение электронных книг", а опять выбрать "Открыть с помощью ..." и из списка установленных приложений выбрать "Чтение электронных книг", предварительно поставив галочку "Установить выбранное приложение по умолчанию для данного типа файлов".
Теперь и внутри архива правильно открывается.
Всем спасибо!