...установить задержку для исполнения команды в автозапуске.
В каталоге /etc/xdg/autostart отредактируйте .desktop-файл запускающий вашу программу.
Добавьте в него следующие строки:
X-GNOME-Autostart-Phase=Application
X-GNOME-Autostart-Delay=10
Этот файл общесистемный - действует на всех пользователей, для редактирования требуются root-привилегии.
Если программа запускается для одного конкретного пользователя, то редактируйте файл в каталоге /home/user/.config/autostart.