Atom фолдит (сворачивает) текст ориентируясь на табуляции, можно ли сделать так, чтобы он этого не делал, но вместо этого фолдил ориентируясь на специальные символы, например:
"(=" - начало сворачиваемого фрагмента
"=)" - конец сворачиваемого фрагмента.