Вообще в WINE есть такая неисправность.. Допустим, есть прога... Явно не DOSовская, проде бы просто под Windows.. Так вот, если её запускать кликом мыши (то бишь из графического интерфейса), то всё работает, а вот если из терминала - выходит куча сообщений, говорящих о невозможности прочитать что то там.. В конце концов прога не запускается - выдаёт ошибку: дескать, не нашла какие то нужные ей файлы.... И так не с одной конкретной прогой.
Эту проблему пока не решил, да и не очень она насущная...