Потому что в данном случае сеть поднимается средствами Network Manager'а, а не init-скриптом networking. А Network Manager работает в GNOME, а GNOME запущен под X-сервером, соответственно убивая Xorg, убиваешь и GNOME и все его программы включая Network Manager. Более подробно разжевать думаю будет сложно.