Система стартует, инициирует загрузку, запускает иксы, обращается к файлу конфигурации. Там ей говорят, что надо пользоваться какими-то странными устройствами. Перед тем, как осознать настройки, система успевает спросить юзернейм (иногда пароль). После этого на экран подаётся салат. Как-то так, наверное.
Последовательно если, то наверное дело было так:
1. Я снёс нужные системе файлы.
2. Система стала запускаться только из рекавери-режима.
3. Были проведена попытка пофиксить систему из меню восстановления (починка
dpkg, починка
X-сервера)
3. Я восстановил нужные системе файлы из бэкапа.
5. Система стала загружаться в обычном режиме, но в консоли.
6. Была проведена повторная попытка пофиксить систему из меню восстановления (починка
dpkg, починка
X-сервера)
5. Видимо, в этот момент, файл
xorg.conf как-то хитро забэкапился.
4. Система стала выдавать салат.
Я тоже не могу сейчас точно сказать, что менно получилось в результате чего. Моделировать повторно не буду

Догадки - приветствуются)
Но лучше на обозначенный
синим вопрос ответьте, это интереснее.