Раздел не накрылся, скорее накрывается жесткий диск, случайно не фуджицио ? больно ситуация схожа с тем что у меня было, правда сначала он тупо трещал, так как была тестовая машинка ни кто не парился, иногда подвисл при загрузке (реально на слух обходили - диск остановился, немного шлепнуть там где диск, он и оживал) а потом вот вообще все слетело, причем так же бут остался свап тоже, ext3 исчез, что говорит в пользу ZFS либо райзерфс.