У меня АСУС М2N-Sli D. Linux всё выключает, как ни странно. (ЗЫ у меня мышь и клавиатура USB. Клава беспроводная, мышь X7 от A4).
Но есть одна удобная глюка. Если устройство при выключении было подключено то питание на него пропадает. Если устройство подключить к выключеному ПК то оно начинает питаться от него. советую обновить биос