У меня системная плата Asus P5QL-E (Intel P43\ICH10R). Все винты поддерживают NCQ.
В винде включение AHCI, дает прирост производительности до 10%, а как в Linuxе успехи с AHCI?
Проблем с нет?
Одно время в винде были ошибки страничного обмена, которые решились обновлением драйверов.
Беглым поиском нашел, что рекомендуется дисковый планировщик поменять на No-Op.