Эти дрова надо ставить при отключеных иксах в консоли, имея при этом весь комплект программ для компиляции.
А чем не угодили проприетарные драйвера?
А вообще, если решил с сайта run ставить, то надо жмакать CTRL+ALT+F1 и sudo /etc/init.d/gdm stop, после чего в консоли писать sh nvidia-xxxxxx.run (название твоего файла дров). Должна начаться установка, компиляция, настройка.