Первая проблема в том, что eBox не только меняет конфиги демонов, но и хранит их отдельно, и при перезагрузке он перезаписывает системные конфиги своими. Вторая проблема - это возможное различие в компонентах eBox и Abills. Теоритически их можно попробывать заставить работать в месте. Лично я бы не стал.