Нет, это не то, что мне нужно)). Ну, пожалуй, подробней расскажу что мне нужно.
Мне надо написать такой скрипт во внешних инструментах, который будет для открытого Java-файла открывать терминал, а в терминале будет запускать Java-приложение, а потом, может быть, даже писать что-нибудь вроде: "для закрытия нажмите <enter>".
Ну вообще такие штуки бывают, наверное, во всех средах разработки. Вот я и хотел настроить таким же образом себе gedit.