Xtrane, если вы считаете, что дело именно в системе, и железо здесь не при чём, то убедиться в этом можно, если загрузиться с liive-cd -- там все настройки дефолтные.
Кстати, до сих пор вы показывали лишь скорость на отдачу, причём с одной сетевой карты и ifconfig, я так понимаю, тоже для этой карты.
Где скорость при скачивании?
Где данные для второй сетевушки?