В общем-то прямая конвертация не пройдёт, но...
Если я правильно понял, что пойдёт переход на Ubuntu с уничтожением Windows, а на D:\ сейчас занято меньше половины, можно:
1) Из-под Acronis-а или другой утилиты сократить размер D:\ минимум вдвое.
2) При установке Ubuntu разметить диск вручную (там несложно, никакой консоли

). При этом на месте C:\ создать ext3 или ext4 раздел на 16Гб с точкой монтирования / и 4 Гб swap. На "откушеном" от D:\ куске создать ext3 или ext4 раздел с точкой монтирования /home.
3) После установки Ubuntu подмонтировать NTFS (остаток D:\ с данными) в режиме "только чтения" (так безопаснее) и перекатать все данные в /home
4) Скачать CloneZilla, и загрузившись с полученного диска, стереть раздел D:\, передвинуть /home, чтобы он разместился сразу за свопом, растянуть /home на всё свободное место. Дать CloneZilla час-полтора на выполнение заданий (чем меньше данных, тем быстрее всё пройдёт)
P.S.: Надо быть очень внимательным при удалении разделов. Кстати, если есть возможность откусить от D:\ больше половины, лучше так и сделать: при редактировании разделов будут видны только их размеры, и когда они неравны гораздо сложнее допустить ошибку.