Логи посмотрите, /var/log/syslog в первую очередь. И плюс подумайте, что вы такого наставили-понастраивали, что могло бы привести к такому поведению. Похоже на глюк рабочей среды, соотв. надо копать в торону программ, которые залазили в раб. среду, например, движков GTK тем.