"Через баш или питон не проще будет?"
Мне надо запустить РНР скрипт причём здесь баш и питон, не совсем понятно. Тем более их я не знаю.
Обычно стоит задача не "запустить похапэ-скрипт", а что-то сделать. А что-то делать на домашнем компе средствами пхп как минимум странно.
Если просто запустить * * * * * root /usr/bin/php /path/script.php
То файл(который должен создаться после работы РНР скрипта) создаётся в каком-то другом месте.
И кстати, если запустить в командной строке /usr/bin/php /path/script.php, то файл создаётся не в той директории в которой скрипт, а из той директории, из которой запущена команда.
Измени скрипт, чтобы писал в нужную папку: или просто напиши в скрипте полный путь, или (если скрипт предполагается использовать из разных мест) используй переменную, в которой сохранен путь до папки.