На диске том надо что-то?
Если нет - то обнулите его просто:
sudo dd if=/dev/zero of=/dev/sdXY
где sdX - имя того диска который обнуляем. ... только ждать долго....
И дальше размечаете как хочется, но можно просто первую и последнюю дорожку прочистить нулями, или наконец уже посмотрите в начало темы и попробуйте
sudo mdadm --misc --zero-superblock /dev/sdX
...это - будет гораздо быстрее...