Такая же проблема. Уже конкретно достало!!!
Тут однозначно глюки идут от связки ядро+видео дрова (и еще возможно, Google Chrome). Видео - GF8600GTS. Если загрузиться в режиме Unity2D, то все работает отлично (но медленно

Также я активно использую несколько рабочих столов.) Так что без видео-драйверов - никак. Однажды было обновление драйверов - и все работало нормально. Но потом опять обновилось ядро, обновился хром, обновились дрова - и опять пошли глюки. Вот и не понятно, кто виноват: или ядро, или дрова, или браузер, или флешплеер в браузере. Заметил, если в хроме смотреть видео, то шанс словить глюк сильно увеличивается.
Достало!!! Работать невозможно, т.к. в любой момент может произойти вылет сеанса.
Народ, помогите. Я вспоминаю прекрасное время, когда 10.х и 11.х работали "как часы" и подобных проблем никогда не было. А эта LTS - жесть. Хоть бери и обратно откатывайся на 11.10.
p.s. тоже устанавливал систему на чистый веник.