После успешного выполнения
sudo chown -R yaxess /usr/
лично для себя я бы решил, что быстрее переставить систему, чем вылавливать всех "блох в стоге сена".
Что делать? Решать Вам. Я бы подождал кто что добавит в тему. Потом - действовал.
Установив root владельцем /usr/**, и прочее подобное, в теории можно получить с виду рабочую систему, но будет она глючная. Глючная - в пределе, устремляя в бесконечность время и наборы возможных конфигураций, зависит от конкретного софта. Дешевле переставить.
Перед тем как ставить, можно решить как быть в каталоге /home с домашними каталогами пользователей. 1) - обязательно сохранить на внешний носитель каталоги из /home и важные личные данные в них. Потом - можно ставить поверх (никогда не пробовал), можно переименовать каталоги, поставить начисто, потом из старых каталогов вынуть в новое место необходимые настройки/файлы почты и т.п. Если /home был в отдельном разделе, то системный можно форматировать. Если уверенности нет, то с загрузившись с компакта можно удалить всё кроме /home и ставить начисто. Полезно подумать, нет ли в /etc, /usr, /opt чего-нибудь что жалко терять. Можно каталог /etc архивнуть на флешку, потом доставать оттуда настройки, по мере течения жизни.
При загрузке с CD (может быть на alternate Ubuntu CD) есть пунктик "rescue broken system". Не пользовался. По смыслу подходит. Сначала надо прочитать описание, что он делает, с какой целью, в каких обстоятельствах. Аналогичный пункт "resque" может быть доступен при загрузке без CD в resque режиме. Или даже сразу в меню Grub (точно - не помню, но есть такой), или после выбора аварийной загрузки, дальше там, в "цветном" текстовом меню.
Если меню Граб не видно, то надо сразу после включения комп-а ловко держать нажатым Shift - меню появится. Shift надо нажимать ловко. На некоторых системах надо было угадать окончание POST диагностики BIOS и момент начала запуска Grub, нажать за долю секунды до "момента". На некоторых системах всё без фокусов - включил, сразу нажал, не отпуская дождался меню. На help.ubuntu.ru наверняка есть статейка.
Удачи.
P.S. После
chmod go-rwx /usr/
не видно возврата прав на /usr только, прав для остальных пользователей.
Пользователь решил продолжить мысль 05 Июля 2012, 17:19:57:
sudo apt-get install wine1.5
sudo apt-get remove wine1.5
У apt-get ещё действие purge. Удаление ещё и конфигураций и т.п.
Есть команда dpkg-reconfigure. Может помочь при возне и жонглировании с конфигурациями и наборами софта.
Экспериментировать можно в VirtualBox (на сайте обычно более свежие версии, нежели в репах). Поставить в него систему, отработать нужное, внедрить на живой системе. На счёт игр и т.п., где важно непосредственное взаимодействие с железкой живой системы - тут будут ньюансы, но всё равно начать можно в VBox.